Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MsraQ9D6Y7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms