Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc94Q9D6J3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms