Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc81Q9D5W4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms