Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms