Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb1Q9D5L7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb1Q9D5L7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb1Q9D5L7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spsb1Q9D5L7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb1Q9D5L7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms