Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933402D24RikQ9D4D3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms