Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap53Q9D439 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms