Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus10Q9D3U0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus10Q9D3U0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pus10Q9D3U0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus10Q9D3U0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms