Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rufy3Q9D394 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms