Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trmt44Q9D2Q2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trmt44Q9D2Q2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt44Q9D2Q2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt44Q9D2Q2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt44Q9D2Q2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt44Q9D2Q2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt44Q9D2Q2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt44Q9D2Q2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt44Q9D2Q2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms