Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhdc8bQ9D2D9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhdc8bQ9D2D9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms