Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc6bQ9D289 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms