Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms