Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syf2Q9D198 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms