Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MthfsQ9D110 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MthfsQ9D110 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MthfsQ9D110 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms