Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms