Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca7Q9D0M2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms