Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2e1Q9D0D5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms