Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3110001I22RikQ9CZ70 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
3110001I22RikQ9CZ70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms