Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx7Q9CY18 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms