Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms