Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prdm5Q9CXE0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm5Q9CXE0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms