Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sugt1Q9CX34 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sugt1Q9CX34 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sugt1Q9CX34 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sugt1Q9CX34 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sugt1Q9CX34 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sugt1Q9CX34 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sugt1Q9CX34 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sugt1Q9CX34 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sugt1Q9CX34 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms