Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnih4Q9CX13 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnih4Q9CX13 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnih4Q9CX13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnih4Q9CX13 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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