Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm8aQ9CWZ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms