Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BccipQ9CWI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BccipQ9CWI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms