Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Raver1Q9CW46 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Raver1Q9CW46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms