Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms