Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkiras2Q9CR56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms