Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms