Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR50

Rchy1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rchy1Q9CR50 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rchy1Q9CR50 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rchy1Q9CR50 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms