Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ska2Q9CR46 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ska2Q9CR46 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ska2Q9CR46 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ska2Q9CR46 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ska2Q9CR46 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ska2Q9CR46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ska2Q9CR46 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ska2Q9CR46 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms