Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HypkQ9CR41 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HypkQ9CR41 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms