Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms