Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdm1Q9CQK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms