Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms