Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkp2Q9CQ73 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp2Q9CQ73 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms