Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2afb1Q9CQ70 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms