Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms