Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trim12aQ99PQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms