Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg5Q99PE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg5Q99PE8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcg5Q99PE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms