Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a5Q99NH7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a5Q99NH7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms