Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b1Q99NB9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b1Q99NB9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms