Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl3Q99N95 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl3Q99N95 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl3Q99N95 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl3Q99N95 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl3Q99N95 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl3Q99N95 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms