Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc1Q99MR8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc1Q99MR8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms