Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnpo2Q99LG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms