Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnajb11Q99KV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajb11Q99KV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms