Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf19Q99KP6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prpf19Q99KP6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms