Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms