Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed9Q99KF1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms